Existen diversos virus y malware que desactivan las opciones de carpeta (folder options) para prevenir que un usuario pueda habilitar el poder ver archivos y carpetas invisibles, así como carpetas de sistema.
La solución es habilitarlo directamente desde el Registry.
Esta es la llave que hay que modificar:
[ H K E Y _ C U R R E N T _ U S E R \ S o f t w a r e \ M i c r o s o f t \ W i n d o w s \ C u r r e n t V e r s i o n \ P o l i c i e s ]
“NoFolderOptions“=dword:00000000